MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Coprococcus catus GD/7 draft genome

Total Repeats: 18149

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021009	TCC	2	6	561	566	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_021009	A	6	6	624	629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021009	A	6	6	637	642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021009	AGTA	2	8	690	697	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021009	TA	3	6	696	701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021009	AGG	2	6	739	744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021009	TAT	2	6	1830	1835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021009	GTT	2	6	5378	5383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021009	GAT	2	6	5424	5429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021009	ATT	2	6	5504	5509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021009	GT	3	6	5522	5527	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021009	GA	3	6	5661	5666	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021009	GCC	2	6	5704	5709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_021009	GGA	2	6	5724	5729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021009	GAG	2	6	5776	5781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021009	GCG	2	6	5844	5849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_021009	AT	3	6	5878	5883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021009	TTTCTA	2	12	5895	5906	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_021009	CGA	2	6	5909	5914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021009	T	6	6	5918	5923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021009	CTT	2	6	5953	5958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_021009	GAT	2	6	5962	5967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021009	ACG	2	6	5980	5985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021009	CAGT	2	8	6090	6097	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021009	GAT	2	6	6106	6111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021009	ATT	2	6	6130	6135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021009	TTG	2	6	6143	6148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021009	AGA	2	6	6152	6157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021009	AAG	2	6	6197	6202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021009	A	6	6	6234	6239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021009	AG	3	6	6249	6254	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021009	A	7	7	7556	7562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021009	GTT	3	9	7840	7848	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021009	TGT	2	6	7877	7882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021009	CTT	2	6	7919	7924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_021009	TAA	2	6	7946	7951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021009	TAT	2	6	7952	7957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021009	AT	3	6	7956	7961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021009	ATT	2	6	7986	7991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021009	TAG	2	6	8004	8009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021009	TAAAA	2	10	8021	8030	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021009	A	6	6	8027	8032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021009	A	6	6	8039	8044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021009	ATTG	2	8	8047	8054	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021009	A	6	6	8060	8065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021009	CA	3	6	8093	8098	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_021009	ATG	2	6	8147	8152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021009	AGTAT	2	10	8184	8193	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021009	GCA	2	6	8195	8200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_021009	A	6	6	8202	8207	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021009	AG	4	8	8219	8226	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021009	T	6	6	13141	13146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021009	TAT	2	6	13221	13226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021009	A	6	6	13299	13304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021009	ATT	2	6	13329	13334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021009	AAGTG	2	10	13389	13398	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021009	TGA	2	6	13407	13412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021009	CA	3	6	14103	14108	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021009	CATTT	2	10	14140	14149	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_021009	ATG	2	6	14169	14174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021009	TTTG	2	8	14224	14231	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021009	ATG	2	6	14235	14240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021009	CTC	2	6	14283	14288	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_021009	ATG	2	6	14301	14306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021009	CAA	2	6	14328	14333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021009	ATCT	2	8	14345	14352	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_021009	CTG	2	6	14354	14359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_021009	ATG	2	6	14367	14372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021009	A	6	6	14416	14421	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021009	ATG	2	6	14433	14438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021009	ATG	2	6	14499	14504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021009	ATG	2	6	14565	14570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021009	CAG	2	6	14595	14600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_021009	ATG	2	6	14631	14636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021009	ATG	2	6	14697	14702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021009	AGA	2	6	14740	14745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021009	ATG	2	6	14763	14768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021009	ATG	2	6	14829	14834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021009	GGA	2	6	14860	14865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021009	ATG	2	6	14895	14900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021009	GCT	2	6	14921	14926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_021009	ATG	2	6	14961	14966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021009	ATG	2	6	15027	15032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021009	GCT	2	6	15053	15058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021009	T	6	6	15062	15067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021009	ATG	2	6	15093	15098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021009	ATG	2	6	15159	15164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021009	ATTT	2	8	15184	15191	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021009	TCC	2	6	15200	15205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_021009	ATG	2	6	15223	15228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021009	TA	3	6	15280	15285	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021009	GA	3	6	15288	15293	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021009	AGG	2	6	15300	15305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021009	AT	3	6	17701	17706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021009	TGCA	2	8	17775	17782	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_021009	GAT	2	6	17820	17825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021009	TAA	2	6	17864	17869	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021009	AT	3	6	17874	17879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021009	A	7	7	17918	17924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021009	AGG	2	6	17972	17977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021009	GAA	2	6	18711	18716	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021009	TGTA	2	8	20175	20182	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021009	T	7	7	20235	20241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021009	GAAT	2	8	20323	20330	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_021009	GGA	2	6	20363	20368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021009	GAA	2	6	20372	20377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021009	TG	3	6	23285	23290	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021009	TGA	2	6	23321	23326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021009	TTG	2	6	25912	25917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021009	AC	3	6	25918	25923	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_021009	TAA	2	6	26051	26056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021009	AGG	2	6	27382	27387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021009	GAT	2	6	30026	30031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021009	GTC	2	6	31020	31025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_021009	GCG	2	6	31044	31049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_021009	AAAC	2	8	32038	32045	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_021009	GCG	2	6	32141	32146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_021009	GTTT	2	8	32171	32178	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021009	AAT	2	6	33141	33146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021009	TAAA	2	8	33155	33162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021009	T	6	6	33195	33200	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021009	TA	3	6	33339	33344	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_021009	ATA	2	6	34237	34242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021009	GCG	2	6	34269	34274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021009	AGA	2	6	36173	36178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021009	TAA	2	6	36182	36187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021009	TATAA	2	10	36260	36269	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021009	AAG	2	6	36275	36280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021009	TAA	2	6	37377	37382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021009	AAT	2	6	37389	37394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021009	TA	3	6	37454	37459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021009	AT	3	6	37462	37467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_021009	GGA	2	6	37471	37476	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_021009	TAT	3	9	37481	37489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021009	ATT	2	6	38958	38963	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021009	GAT	2	6	38994	38999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021009	AT	3	6	39014	39019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021009	ATTA	2	8	40107	40114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021009	T	7	7	40160	40166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021009	TTTTAT	2	12	40184	40195	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021009	G	6	6	40221	40226	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021009	ACT	2	6	40293	40298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_021009	ATT	2	6	40301	40306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021009	GA	4	8	40344	40351	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021009	GGA	2	6	40354	40359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021009	ACA	2	6	43005	43010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_021009	TTTTG	2	10	43044	43053	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021009	TGA	2	6	43058	43063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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293	NC_021009	N	1130	1130	98817	99946	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_021009	TGT	2	6	100842	100847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
295	NC_021009	TCG	2	6	100884	100889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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298	NC_021009	GGA	2	6	100998	101003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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329	NC_021009	AAC	2	6	115881	115886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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423	NC_021009	CCT	2	6	137881	137886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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425	NC_021009	CT	3	6	137988	137993	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
426	NC_021009	CACT	2	8	137995	138002	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
427	NC_021009	TAT	2	6	138060	138065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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429	NC_021009	A	6	6	138094	138099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
430	NC_021009	GTG	2	6	138124	138129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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